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Anpassungsstrategien von Clostridioides difficile während der Infektion

Über das Projekt

Das Bakterium Clostridioides difficile (ehemals: Clostridium difficile) verursacht derzeit eine hohe Anzahl von Krankheitsfällen mit Hunderten, wenn nicht Tausenden von Todesfällen pro Jahr. Die C. difficile assoziierte Diarrhoe (CDAD) ist eine der gefährlichsten im Krankenhaus erworbenen Infektionen

Projektförderung

Gefördert wird das Projekt im Rahmen des Norddeutschen Zentrums für Mikrobielle Genomforschung (NZMG) vom Land Niedersachsen aus Mitteln des Niedersächischen Vorabs der VolkswagenStiftung.

Projektinformationen

  • Förderungsdauer: 3. Förderperiode 2018-2020

Projektpartner

  • Leibniz-Institut DSMZ-Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH
  • Friedrich-Loeffler-Institut
  • Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung
  • Medizinische Hochschule Hannover
  • Twincore Hannover
  • Universität Greifswald
  • Universitätsmedizin Göttingen

Systembiologie von C.difficile

Pipette und 96 well Platte

Das Darmbakterium C. difficile verursacht lebensbedrohliche Erkrankungen, von Durchfall bis hin zu schweren Entzündungen des Darms, die insbesondere nach Antibiotika-Behandlung auftreten. Die schwerste Ausprägungsform ist ein toxisches Megakolon, eine sehr schmerzhafte Erweiterung des Darms, die zu mehreren tausend Todesfällen pro Jahr in Deutschland führt. Bis vor kurzem gab es in Deutschland keine koordinierte Forschung zu diesem wichtigen Krankheitserreger. Mit Unterstützung der Länder Niedersachsen und Mecklenburg-Vorpommern hat sich 2013 ein Konsortium für die C. difficile-Forschung gegründet. Das Konsortium ist sehr interdisziplinär und untersucht gezielt in unterschiedlichen Projektbereichen die Rolle bakterieller Anpassungsmechanismen, die Wirkung der Toxine und die Wirkung des Mikrobioms (die Gesamtheit aller Bakterien im Darm) bei C. difficile-Infektionen.

iel ist ein grundlegendes Verständnis des Organismus in seiner Umgebung, das zur Entwicklung von Therapien und Diagnostik von C.difficile-Infektionen genutzt werden kann.

Projektbereiche

Anaeroben Bank

Im Projektbereich A (Anpassung) werden die Veränderungen im Bakterium während der Infektion untersucht. In einem systembiologischen Ansatz werden die Untersuchungen mit Hilfe der OMICs-Technologien auf allen Ebenen der Zelle durchgeführt. Basierend auf computergestützten Methoden erfolgt anschließend die entscheidende Zusammenführung der komplexen experimentellen Messdaten. Ziel ist es, die regulatorischen Netzwerke und den Stoffwechsel von C. difficile während des Infektionsprozesses zu verstehen.

Im Projektbereich B (Toxine) wird die Wirkung der von C. difficile gebildeten Gifte auf die menschlichen Zellen im Darm untersucht. Hier wird aufgeklärt, welche Reaktionen in den Proteinen und im Stoffwechsel der Wirtszelle ausgelöst werden. Dabei spielen auch andere Faktoren im Darm eine Rolle, zum Beispiel körpereigene Gallensäuren und Schleimbildung. Ziel ist es, die molekularen Mechanismen zu verstehen, die dem komplexen Krankheitsbild zugrunde liegen.

Im Projektbereich C (Mikrobiom) wird das Zusammenspiel zwischen C. difficile-Bakterien und dem Mikrobiom untersucht. Hier werden die OMICs-Technologien zur Untersuchung von Veränderungen des Mikrobioms bei C. difficile-Infektionen angewendet („Meta-Omics“), wobei das Schwein als Modellorganismus etabliert wird. Auch die Interaktionen des Immunsystems mit dem Mikrobiom bei rekurrenten Infektionen werden hier untersucht. Ziel ist es, den Einfluss des Mikrobioms auf den Ausbruch und die Überwindung der Infektion zu verstehen.

In den drei Projektbereichen werden alle aktuell hoch relevanten Fragestellungen zu C. difficile umfassend bearbeitet.

Details des Projekts


Kontakt

Sprecher

Prof. Dr. Dieter Jahn

Technische Universität Braunschweig
Institut für Mikrobiologie
+49 531-391-55101

Email: d.jahn@tu-braunschweig.de

Projektkoordination

Dr. Anita Remus

Technische Universität Braunschweig
BRICS
+49 531-391-55102

Email: a.remus@tu-braunschweig.de