Mit einigen Schulen arbeitet das Agnes-Pockels-Labor intensiv zusammen, z. B. werden neue Versuchsreihen mit Klassen dieser Schulen ausprobiert und optimiert. Klassen aus den Partnerschulen besuchen das Agnes-Pockels-Labor regelmäßig zu ausgewählten Versuchsreihen.
Einige Lehrkräfte aus diesen Schulen waren oder sind im Agnes-Pockels-Labor z. B. als Lehrkraftabordnungen tätig.
Gunzelin Realschule Peine
Hoffmann-von-Fallersleben Gymnasium in Braunschweig
Hoffmann-van-Fallersleben Realschule in Wolfsburg
IGS Franzsches Feld in Braunschweig
IGS Henriette-Breymann-Schule Wolfenbüttel
Realschule Maschstraße in Braunschweig